近日，我院动物生态及保护生物学团队青年教师谷桐桐博士联合云南大学生命科学学院于黎研究员团队在国际期刊Molecular Biology and Evolution (JCR和中科院双一区，5年影响影子11.9)发表了题为“Large-scale genomic phylogeography provides insights into evolutionary history and conservation priorities of the white-bellied pangolin (Phataginus tricuspis)”的研究论文。该研究针对白腹长尾穿山甲系统开展大规模基因组谱系地理与保护遗传学分析，为白腹长尾穿山甲的进化历史和保护重点提供了新见解。

白腹长尾穿山甲（Phataginus tricuspis，树穿山甲）为非洲热带雨林珍稀哺乳动物，对环境变化敏感，是研究森林演化与生物地理格局的重要指示物种。受野味消费、传统医药利用及鳞片非法贸易影响，其种群持续下降，是受威胁最严重的野生哺乳动物之一。目前其演化历史、谱系分化及种群衰退的遗传学效应仍缺乏系统研究。科研团队联合国内外机构，构建覆盖全分布区的遗传资源库，获取209个高质量全基因组（含100个新测序样本）和215条线粒体基因组序列，开展谱系地理与保护遗传学分析，阐明其演化历史、种群动态与遗传结构，为保护优先级划定及国际协同保护提供科学依据（图 1）。

研究揭示白腹长尾穿山甲存在4个核基因组遗传谱系、6个线粒体遗传谱系，存在显著核‑线粒体遗传不一致。更新世避难所与河流屏障共同驱动其遗传分化，历史种群波动受冰期‑间冰期旋回影响，近期种群骤降源于国际贸易驱动的过度利用。基因组分析显示，尼日利亚与西非谱系遗传多样性低、近交及遗传负荷高、适应潜力弱，需优先保护。本研究整合核质基因组证据，解决谱系划分争议，阐明核质不一致机制与演化格局，首次在全基因组水平量化种群衰退的遗传效应，为该物种及非洲雨林生物多样性保护提供谱系地理与保护遗传学框架。

图1. 白腹长尾穿山甲保护遗传学研究。a基于全基因组和线粒体基因组的遗传谱系分析；b 群体历史研究；c 不同遗传谱系的遗传后果评估；d 不同遗传谱系未来的演化潜力评估。

本成果的取得，离不开学院长期以来对动物生态及保护生物学团队的悉心培育与平台支撑，是学院聚焦生物学一流学科建设、强化青年科研人才培养与高水平学术团队建设的重要体现。云南师范大学谷桐桐博士、南京林业大学翟天雅博士、云南大学蒋宇硕士为研究论文共同第一作者，云南大学于黎研究员、胡靖扬研究员，香港嘉道理农场暨植物园张华荣博士为论文的共同通讯作者，该研究得到了国家自然科学基金、云南省兴滇英才支持计划、云南省基础研究计划、云南省科技厅-云南大学联合基金、云南大学省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室开放课题以及中央引导地方科技发展资金等项目的资助。