Genomics, Proteomics & Bioinformatics(GPB)在线发表了由云南师范大学生命科学学院黄遵锡教授、中国地质大学(武汉)蒋宏忱教授和中山大学生命科学学院李文均教授课题组合作的题为“Gut Microbiome Variation Along A Lifestyle Gradient Reveals Threats Faced by Asian Elephants”的研究论文。
肠道微生物群落与哺乳动物形成紧密的关系,有助于宿主生理过程、免疫反应和营养代谢。特别是,草食性哺乳动物依靠其特定的肠道微生物类群从食物中提取营养和能量、合成维生素和解毒植物防御化合物。正常的肠道微生物-宿主关系通过健康稳定的饮食、均质地理环境以及长期持续和无波动的生活方式等暴露途径得以维持。这些关系被扰动会导致疾病。而且,很难将饮食和地理因素与生活方式区分开来。因此,了解生活方式如何以及在多大程度上影响宿主肠道微生物仍然是一个巨大的挑战。
亚洲象被列为中国国家一级重点保护野生动物,已被世界自然保护联盟(IUCN)列为濒危物种。野生亚洲象多数分布在中国云南省南部,种群数量为 288 ~ 338 只。云南西双版纳野象谷生活着四种不同生活方式的亚洲象,分别为圈养、半圈养、半野生和野生。这四种生活方式是极其罕见的,因为其系统发育物种单一、生活的地理环境均质以及饮食逐渐变化,更重要的是,四种生活方式一直如此保持了几十年。因此,在四种生活方式中研究亚洲象的肠道微生物组可以帮助了解生活方式如何逐渐影响肠道微生物群的进化。
图2 不同生活方式亚洲象的β多样性分析